Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2OQ9C0C9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE2OQ9C0C9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE2OQ9C0C9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms