Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEMA4CQ9C0C4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEMA4CQ9C0C4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms