Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM6Q9C030 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM6Q9C030 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM6Q9C030 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms