Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A8Q9BY19 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A8Q9BY19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms