Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM2Q9BVW6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM2Q9BVW6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms