Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2AFJQ9BTM1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2AFJQ9BTM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2AFJQ9BTM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms