Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SYT11Q9BT88 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYT11Q9BT88 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYT11Q9BT88 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms