Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HDHD3Q9BSH5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDHD3Q9BSH5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms