Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
C2orf88Q9BSF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C2orf88Q9BSF0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms