Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP3BQ9BS92 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3BQ9BS92 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms