Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00467Q9BRT7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00467Q9BRT7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms