Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TMEM246Q9BRR3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM246Q9BRR3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms