Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF8Q9BRL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SRSF8Q9BRL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms