Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC77Q9BR77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC77Q9BR77 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC77Q9BR77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms