Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYSTQ99698 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYSTQ99698 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms