Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP1R9BQ96SB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP1R9BQ96SB3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP1R9BQ96SB3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms