Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB3IPQ96QF0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB3IPQ96QF0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms