Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TEFMQ96QE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TEFMQ96QE5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms