Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ALS2CR12Q96Q35 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALS2CR12Q96Q35 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms