Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PGLYRP2Q96PD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGLYRP2Q96PD5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms