Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C12orf66Q96MD2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C12orf66Q96MD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C12orf66Q96MD2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C12orf66Q96MD2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C12orf66Q96MD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms