Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CABS1Q96KC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CABS1Q96KC9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABS1Q96KC9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms