Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLPTM1LQ96KA5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.9 ms