Protein–RNA interactions for Protein: Q96HE9

PRR11, Proline-rich protein 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR11Q96HE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRR11Q96HE9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRR11Q96HE9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms