Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTERF3Q96E29 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTERF3Q96E29 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms