Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TIFAQ96CG3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TIFAQ96CG3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms