Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPCDCQ96CD2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPCDCQ96CD2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms