Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFHD2Q96C19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EFHD2Q96C19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EFHD2Q96C19 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms