Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EXOSC8Q96B26 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EXOSC8Q96B26 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms