Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HDAC10Q969S8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HDAC10Q969S8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms