Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNFRSF25Q93038 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNFRSF25Q93038 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNFRSF25Q93038 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms