Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EDAQ92838 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDAQ92838 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDAQ92838 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EDAQ92838 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EDAQ92838 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EDAQ92838 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EDAQ92838 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EDAQ92838 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EDAQ92838 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EDAQ92838 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EDAQ92838 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EDAQ92838 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDAQ92838 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDAQ92838 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDAQ92838 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EDAQ92838 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDAQ92838 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms