Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
U2AF1L4Q8WU68 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
U2AF1L4Q8WU68 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
U2AF1L4Q8WU68 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms