Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SSC4DQ8WTU2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SSC4DQ8WTU2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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