Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX54Q8TDD1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX54Q8TDD1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms