Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRSK1Q8TDC3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRSK1Q8TDC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms