Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCPH1Q8NEM0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCPH1Q8NEM0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCPH1Q8NEM0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms