Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIRREL3Q8IZU9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIRREL3Q8IZU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 627.5 ms