Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLF2Q8IX21 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLF2Q8IX21 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms