Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CHERPQ8IWX8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms