Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN4Q8IWV2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTN4Q8IWV2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN4Q8IWV2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms