Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL3Q8IVW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL3Q8IVW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms