Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y25

ZNF354C, Zinc finger protein 354C, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354CQ86Y25 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF354CQ86Y25 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF354CQ86Y25 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF354CQ86Y25 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms