Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SFR1Q86XK3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFR1Q86XK3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFR1Q86XK3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFR1Q86XK3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFR1Q86XK3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SFR1Q86XK3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SFR1Q86XK3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SFR1Q86XK3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms