Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC6Q7Z403 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC6Q7Z403 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms