Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
USP43Q70EL4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP43Q70EL4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms