Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA0408Q6ZU52 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA0408Q6ZU52 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms