Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C12orf54Q6X4T0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf54Q6X4T0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms