Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD1Q6UWL2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SUSD1Q6UWL2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SUSD1Q6UWL2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms