Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF7

NXPE4, NXPE family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE4Q6UWF7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NXPE4Q6UWF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NXPE4Q6UWF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms